Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui bagaimana motivasi belajar mempengaruhi tingkat partisipasi siswa selama proses pembelajaran dalam program Pendidikan Agama Kristen di IAKN Kupang. Pendekatan penelitian yang digunakan adalah kuantitatif, dengan menggunakan metode korelasional melalui analisis regresi linier sederhana. Subjek penelitian terdiri dari siswa semester enam kelas B, dengan total populasi 35 orang, dan seluruh populasi tersebut dijadikan sampel dengan menggunakan teknik pengambilan sampel jenuh, juga dikenal sebagai sensus. Data dikumpulkan dengan mendistribusikan kuesioner yang terdiri dari 40 pernyataan yang telah diuji validitasnya (dengan koefisien korelasi lebih besar dari 0,344) dan reliabilitasnya (Cronbach's Alpha = 0,977). Data kemudian diolah menggunakan SPSS versi 26. Hasil analisis deskriptif menunjukkan bahwa motivasi belajar siswa (M = 76,91) dan tingkat aktivitas mereka (M = 77,91) berada dalam kategori baik. Berdasarkan uji ANOVA, nilai F yang dihitung adalah 4,526 dengan tingkat signifikansi 0,041 ($ p < 0,05$), sehingga hipotesis nol ($H_0$) ditolak dan hipotesis alternatif ($H_a$) diterima. Ini menunjukkan bahwa ada korelasi positif dan Pengaruh motivasi belajar terhadap aktivitas siswa sangat signifikan , dengan koefisien regresi sebesar 0,300. Nilai R Kuadrat sebesar 0,121 menunjukkan bahwa motivasi belajar berkontribusi sebesar 12,1% terhadap variasi aktivitas siswa, sedangkan sisanya sebesar 87,9% dipengaruhi oleh faktor lain di luar cakupan model penelitian ini. Studi ini menyimpulkan bahwa peningkatan motivasi belajar siswa secara garis lurus akan mengarah pada partisipasi siswa yang lebih tinggi dalam kelas PAK.